実行可能プログラムは，さらに実行時に 「オペレーティングシステム(OS)」の助けを借りて様々な処理を行なう．
一般にユーザのプログラムが，キーボードやディスプレイ， ディスク装置などのハードウェアを直接操作することはない． 必ず，オペレーティングシステムを介する． オペレーティングシステムに仕事を依頼すること， あるいは，その仕事のことを「システムコール」という．
ユーザのプログラムからシステムコールを行うこともできるが， 一般にはライブラリの中の関数を介してオペレーティングシステムを利用することが多い． 実はCでは言語本来の「仕様」として入出力の方法が定められていない． しかし，それでは一般には不便なので，「標準ライブラリ」というものが定められている． 「標準ライブラリ」は，ハードウェアやOSにできるだけ依存せずに， 同じソースコードで基本的な入出力などが実現できるように作られている．